Exploitation des appariements entre les bases SI-VIC, SI-DEP et VAC-SI
jusqu’au 7 novembre 2021.
Entre le 1er et le 7 novembre 2021, le nombre de tests RT-PCR positifs pour 100 000 habitants de 20 ans ou plus augmente : il atteint 185 pour 100 000 habitants non vaccinés contre 156 la semaine précédente, et 47 pour 100 000 habitants vaccinés de 20 ans ou plus contre 38. Il y a ainsi 4 fois plus de tests positifs parmi les personnes non-vaccinées que parmi celles complètement vaccinées de 20 ans ou plus, à taille de population comparable.
Au cours de cette première semaine de novembre, le nombre d’entrées en soins critiques pour les personnes non vaccinées est en hausse : il est de 32 pour 1 million de personnes non-vaccinées de 20 ans ou plus (contre 29 pour 1 million la semaine précédente). Ces dernières représentent 48 % des admissions en soins critiques et 42 % des admissions en hospitalisation conventionnelle, alors qu’elles ne sont que 11 % au sein de l’ensemble de la population des 20 ans ou plus. Chez les personnes complètement vaccinées, les entrées en soins critiques sont également en augmentation : 4 pour 1 million de personnes complètement vaccinées contre 3 la semaine précédente ; cette population représente 49 % des personnes admises en soins critiques et 56 % des personnes admises en hospitalisation conventionnelle alors qu’elle représente 87 % de la population des 20 ans ou plus. Ainsi, à taille de population comparable, il y a environ 8 fois plus d’entrées en soins critiques parmi les personnes âgées de 20 ans ou plus non vaccinées que parmi celles complètement vaccinées.
Par ailleurs du 11 octobre au 7 novembre 2021, on comptabilise 53 décès pour 1 million de personnes non vaccinées de 20 ans ou plus contre 7 pour les personnes complètement vaccinées. Il y a donc environ 8 fois plus de décès chez les personnes non vaccinées que chez les personnes complètement vaccinées à taille de population comparable durant la période considérée.
Les résultats nationaux des appariements ainsi que des déclinaisons régionales et par classe d’âge sont mis à disposition sous forme de graphiques en format pdf et de fichiers csv permettant d’exploiter plus finement les résultats présentés. Ces fichiers sont disponibles sur le site de données ouvertes de la DREES.
Le suivi hebdomadaire du statut vaccinal des personnes testées positives à la Covid-19 et des personnes hospitalisées réalisées par la DREES a fait l’objet d’une révision méthodologique le 29 octobre 2021.
Définitions et méthodes
Les résultats présentés ici sont issus de l’exploitation des appariements entre les données de :
– SI-VIC, base de données sur les hospitalisations conventionnelles ou en soins critiques (réanimation, soins intensifs et soins continus) de patients, hospitalisés pour ou positifs au test Covid-19.
– SI-DEP, base de données sur les résultats des tests de dépistage du virus SARS-CoV-2 causant la Covid-19,
– VAC-SI, base de données sur les vaccinations Covid-19.
Les données utilisées portent sur la période du 31 mai au 7 novembre 2021 et ont été extraites le 16 novembre.
Les décomptes issus de l’appariement des trois bases SI-VIC, SI-DEP, VAC-SIportent sur des personnes dont l’âge est renseigné. De plus, les événements hospitaliers (entrée en hospitalisation conventionnelle, entrée en soins critiques, décès) sont comptabilisés en date de survenue. À l’exception des colonnes « Admissions et décès hospitaliers – Ensemble » du tableau 1, toutes les statistiques d’événements hospitaliers présentées sont établies sur des personnes pour lesquelles au moins un test RT-PCR positif a été identifié entre 21 jours avant l’hospitalisation et 21 jours après l’événement hospitalier (ou la date d’extraction des données pour les statistiques les plus récentes). Cette restriction de champ aux patients admis à l’hôpital ou décédés pour lesquels un test positif a été identifié explique l’écart constaté entre les colonnes « Ensemble » et « dont RT-PCR positive » de la partie « Admissions et décès hospitaliers ».
Les décomptes issus de l’appariement des deux bases SI-DEP et VAC-SI portent sur des nombres de tests RT-PCR en date de prélèvement durant la même période que les statistiques d’hospitalisation et de couverture vaccinale.
Les dénombrements de tests (nombre et résultats positifs) ne sont pas dédoublonnés au-delà de la journée. Autrement dit, lorsqu’une personne réalise plusieurs tests RT-PCR à des dates différentes, les nombres de tests et les positifs associés sont comptés à chaque fois dans les effectifs et ratio. Par ailleurs, on considère comme symptomatiques les personnes dont la variable associée dans SI-DEP indique la présence de symptômes ; les autres pouvant être asymptomatiques ou sans information connue.
Les décès dénombrés de patient positifs Covid-19 sont ceux survenus à l’hôpital (y compris dans d’autres services que ceux d’hospitalisation conventionnelle et de soins critiques, et que le Covid soit le motif d’hospitalisation ou non),enregistrés dans SI-VIC et concernant les seuls patients admis à l’hôpital après le 15 mai – dans le but de centrer l’analyse sur les événements associés à la quatrième vague épidémique. En pratique, les décès sur la période sous revue (qui débute en juillet) de personnes admises à hôpital avant le 15 mai sont très faibles. Par ailleurs, les dénombrements ici présentés (colonne « décès / ensemble » du tableau 1) sont en date de survenue et issus des appariements ; ils ne coïncident donc pas avec les données non appariées et en date d’enregistrement que publie Santé publique France.
En concordance avec les choix effectués par Santé publique France, le statut vaccinal des patients a été défini suivant quatre modalités dont les contours varient suivant le vaccin utilisé et l’antécédent de Covid-19 des patients :
pour les vaccinations sans antécédent de Covid-19 avec vaccins non monodose (hors Janssen) :
– Non vacciné (0) : personne n’ayant jamais reçu d’injection de vaccin contre le Sars-Cov-2
– Primo dose récente (1-) : personne ayant reçu une première dose depuis 14 jours ou moins
– Primo dose efficace (1+) : personne ayant reçu une première dose depuis plus de 14 jours ou ayant reçu une deuxième dose depuis 7 jours ou moins
– Vaccination complète (C) : personne ayant reçu une deuxième dose1 depuis plus de 7 jours
pour les vaccinations sans antécédent de Covid-19 avec vaccin mono dose (Janssen) :
– Non vacciné (0) : personne n’ayant jamais reçu d’injection de vaccin contre le Sars-Cov-2
– Primo dose récente (1-) : personne ayant reçu une dose de Janssen depuis 14 jours ou moins
– Vaccination complète (C) : personne ayant reçu dose de Janssen depuis plus de 14 jours
pour les vaccinations avec antécédent de Covid-19 :
– Non vacciné (0) : personne avec antécédent n’ayant jamais reçu d’injection de vaccin contre le Sars-Cov-2
– Primo dose récente (1-) : personne avec antécédent ayant reçu une dose depuis 7 jours ou moins
– Vaccination complète (C) : personne avec antécédent ayant reçu une dose depuis plus de 7 jours
Les personnes ayant reçu une dose de rappel demeurent considérées comme complètement vaccinées. La date prise en compte pour l’appréciation du statut vaccinal (notamment la distinction entre primo-dose efficace et statut vaccinal complet) est celle de la dose ayant conduit à l’obtention du statut vaccinal complet et non la dose de rappel.
L’identification du statut vaccinal est faite à partir des informations sur les injections dans la base VAC-SI. Une note méthodologique, associée à la publication de la Drees du 29 octobre dernier, détaille les améliorations du traitement appliqué depuis cette date. Elle détaille notamment comment sont prises en compte les observations dont les patients ne peuvent être retrouvés dans les bases VAC-SI.
Les taux de couverture vaccinale utilisés ici ont été estimés par la DREES en mobilisant, pour les numérateurs, la source VAC-SI suivant une extraction issue du portail SNDS de la CNAM. En effet, ce choix permet de décliner les analyses suivant les niveaux régionaux et départementaux de lieu de résidence plus cohérents avec une approche épidémiologique que les décomptes suivant le lieu de vaccination disponible dans la version de VAC-SI mise à disposition pour Santé publique France et la DREES2. Les populations résidentes au 1er janvier 2021 estimées par l’Insee ont été utilisées comme dénominateur des taux de couverture vaccinale. Les effectifs de personnes non vaccinées, qui peuvent être surestimés dans le SNDS, sont établis par différence entre la population résidente et les effectifs de personnes vaccinées.
Les dénombrements de tests, d’entrées, de décès et de population selon le statut vaccinal concernent les populations résidant en France et âgées de 20 ans et plus. Les données pour les personnes de moins de 20 ans sont toutefois disponibles dans les tableaux de données (fichiers « .csv ») mis à disposition.
Pour les tableaux et graphiques présentant des nombres de tests RT-PCR positifs ou d’événements hospitaliers pour 100 000 habitants selon le statut vaccinal, les dénombrements de ces tests positifs ou de ces événements sont rapportés à la population du statut vaccinal 7 jours auparavant, pour tenir compte de l’existence d’un délai entre la date de contamination (non observée) et la date de test ou celle d’hospitalisation.
1Ou une troisième dose s’agissant des personnes immunodéprimées.
2L’information sur le département de résidence n’est disponible dans la version de VAC-SI mise à disposition de la DREES que sur une part des patients et elle est moins fiable que celle disponible via le portail SNDS de la CNAM.
Contact presse : drees-presse@sante.gouv.fr