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Rapport et recommandations sur la mise en œuvre en France des techniques de séquençage de nouvelle génération (Publication)

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Les techniques de séquençage de l’ADN nées à la fin des années 70, se sont automatisées au cours du projet Génome Humain (années 90) pour devenir d’exécution rapide et hautement performantes. On parle aujourd’hui de séquençage de nouvelle génération (« Next generation sequencing » ou NGS). Le coût du nucléotide séquencé a été divisé par 100 000, et le temps d’acquisition des données génomiques extrêmement réduit. Ces progrès répondent aux exigences d’une approche clinique des maladies humaines et d’une médecine personnalisée ou de précision. L’utilisation des données de séquençage du génome du patient permet dans un nombre croissant de cas d’affiner le diagnostic médical et le pronostic, et de choisir le traitement le plus adapté à la pathologie décelée.

> http://www.academie-medecine.fr/articles-du-bulletin/publication/?idpublication=100490

A l’issue de l’analyse de la situation présente dans notre pays, l’Académie nationale de médecine et l’Académie des technologies formulent les recommandations suivantes parmi lesquelles les quatrième et cinquième supposent une modification de la législation :

Mettre en place une unité de démonstration d’une taille suffisante pour réaliser de l’ordre 40.000 analyses de génomes complets par an, leur stockage numérisé et leur interprétation en y associant le plus grand nombre de partenaires « utilisateurs » possibles qui participeront ainsi à la création de valeur ;
Favoriser la création d’une société française ou européenne fabriquant des appareils de séquençage de capacité équivalente ou supérieure à celle proposée par Illumina Inc afin de mettre fin à terme au monopole de cette société américaine. ;
Développer en amont du séquençage, des approches microfluidiques de préparation des échantillons, et en aval, des logiciels d’interprétation des données en établissant les contacts nécessaires entre industriels et généticiens.
Modifier la réglementation actuelle, imposant à tout projet de recherche impliquant le séquençage des génomes de dépendre d’une hypothèse physiopathologique dans la mesure où l’objectif recherché par ce séquençage systématique est l’établissement de cette relation.
Faciliter, en matière de recherches, sous le contrôle de la CNIL, le croisement de fichiers de données génétiques avec des fichiers de données cliniques concernant les mêmes malades en respectant l’anonymat des patients.
Prévoir dans un second temps la création de 10 à 15 centres répartis sur le territoire, reliés entre eux et inter opérationnels et, de plus, connectés à un centre collectant l’ensemble des données génomiques mais, également, toutes les autres données.

Francis Galibert et Bruno Jarry au nom d’un groupe de travail commun à l’Académie nationale de médecine et à l’Académie de technologie.

Contact presse :
Nicole Priollaud
nicole.priollaud@wanadoo.fr

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